Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRIM21P19474 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms