Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EPCAMP16422 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms