Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMP1P11279 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms