Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MCF2P10911 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MCF2P10911 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MCF2P10911 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCF2P10911 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCF2P10911 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCF2P10911 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCF2P10911 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCF2P10911 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCF2P10911 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MCF2P10911 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms