Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCL3P10147 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCL3P10147 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms