Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI3P10071 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI3P10071 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms