Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPBP07199 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPBP07199 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPBP07199 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CENPBP07199 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CENPBP07199 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPBP07199 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms