Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL3A1P02461 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL3A1P02461 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms