Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSD2O96028 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSD2O96028 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSD2O96028 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSD2O96028 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms