Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POP4O95707 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POP4O95707 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POP4O95707 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POP4O95707 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms