Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CREB3O43889 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CREB3O43889 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CREB3O43889 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB3O43889 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CREB3O43889 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CREB3O43889 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms