Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DENRO43583 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DENRO43583 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms