Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PLXNB1O43157 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PLXNB1O43157 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms