Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LAMA5O15230 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms