Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR3AO14802 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms