Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN8O00124 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN8O00124 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms