Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PCH4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PCH4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PCH4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PCH4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E9PCH4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E9PCH4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms