Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
LINC00587B1AMM8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
LINC00587B1AMM8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms