Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPIPB13A6NJU9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NPIPB13A6NJU9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms