Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms