Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC182A6NF36 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms