Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSDA5PKW4 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms