Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J6

KCNE2, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE2Q9Y6J6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNE2Q9Y6J6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNE2Q9Y6J6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNE2Q9Y6J6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNE2Q9Y6J6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms