Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPO11Q9Y5K1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPO11Q9Y5K1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPO11Q9Y5K1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SPO11Q9Y5K1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPO11Q9Y5K1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPO11Q9Y5K1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPO11Q9Y5K1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms