Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANGPTL3Q9Y5C1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANGPTL3Q9Y5C1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANGPTL3Q9Y5C1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANGPTL3Q9Y5C1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANGPTL3Q9Y5C1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ANGPTL3Q9Y5C1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ANGPTL3Q9Y5C1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267 ms