Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP4S1Q9Y587 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP4S1Q9Y587 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP4S1Q9Y587 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP4S1Q9Y587 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms