Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YBX2Q9Y2T7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
YBX2Q9Y2T7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
YBX2Q9Y2T7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
YBX2Q9Y2T7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms