Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSX2IPQ9Y2D8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms