Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SHOC2Q9UQ13 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SHOC2Q9UQ13 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHOC2Q9UQ13 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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