Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MAPRE3Q9UPY8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MAPRE3Q9UPY8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAPRE3Q9UPY8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms