Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP24Q9UPU5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP24Q9UPU5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP24Q9UPU5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms