Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPT2Q9UMR5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPT2Q9UMR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPT2Q9UMR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms