Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CIZ1Q9ULV3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CIZ1Q9ULV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CIZ1Q9ULV3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CIZ1Q9ULV3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 287 ms