Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMCC3Q9ULS5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCC3Q9ULS5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCC3Q9ULS5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms