Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC2LQ9UL33 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC2LQ9UL33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms