Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGA11Q9UKX5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGA11Q9UKX5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGA11Q9UKX5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms