Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBD1Q9UJT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBD1Q9UJT1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBD1Q9UJT1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms