Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCM8Q9UJA3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCM8Q9UJA3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCM8Q9UJA3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms