Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC24A2Q9UI40 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC24A2Q9UI40 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC24A2Q9UI40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms