Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRF1LQ9UGC7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MTRF1LQ9UGC7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTRF1LQ9UGC7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTRF1LQ9UGC7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms