Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC17A7Q9P2U7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC17A7Q9P2U7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms