Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VAPAQ9P0L0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAPAQ9P0L0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VAPAQ9P0L0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms