Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVT9

ARMC1, Armadillo repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC1Q9NVT9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARMC1Q9NVT9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARMC1Q9NVT9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARMC1Q9NVT9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARMC1Q9NVT9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARMC1Q9NVT9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARMC1Q9NVT9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARMC1Q9NVT9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARMC1Q9NVT9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARMC1Q9NVT9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms