Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVL1

FAM86C1, Protein FAM86C1, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM86C1Q9NVL1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM86C1Q9NVL1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM86C1Q9NVL1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM86C1Q9NVL1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM86C1Q9NVL1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms