Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAJC11Q9NVH1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DNAJC11Q9NVH1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DNAJC11Q9NVH1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms