Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EMILIN3Q9NT22 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EMILIN3Q9NT22 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EMILIN3Q9NT22 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EMILIN3Q9NT22 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EMILIN3Q9NT22 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EMILIN3Q9NT22 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EMILIN3Q9NT22 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EMILIN3Q9NT22 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EMILIN3Q9NT22 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.4 ms