Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CENPMQ9NSP4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CENPMQ9NSP4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms