Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF275Q9NSD4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF275Q9NSD4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF275Q9NSD4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF275Q9NSD4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms