Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCL28Q9NRJ3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCL28Q9NRJ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCL28Q9NRJ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms