Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE3Q9NRF9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE3Q9NRF9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms